More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  58.03 
 
 		 284 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  58.33 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  52.67 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  56.2 
 
 		 276 aa  255  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  52.45 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  49.29 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  51.59 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  50.88 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  46.76 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  51.08 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  40.75 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.34 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  30.53 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  36.33 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  36.49 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  40.07 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  29.82 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  35.53 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  30.77 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  41.09 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  34.78 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  31.1 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  35.48 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  35.48 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  35.13 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  35.46 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  35.48 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  32.62 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  35.13 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.86 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  34.52 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  34.52 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  34.52 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  34.52 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  34.52 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  36.49 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  34.16 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  34.16 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  34.16 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  36.42 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  35.94 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  36.84 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.11 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  37.63 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  33.21 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  30.82 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  33.94 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  33.81 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  33.92 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.9 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  33.21 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  31.49 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  32.14 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  35.21 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  34.72 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  32.32 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  36.65 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  30.51 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  35.61 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  39.42 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  35.04 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  32.87 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  32.31 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.63 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  32.19 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  30.56 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  34.05 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  34.6 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  33.33 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  34.26 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  33.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.47 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  38.69 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.45 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  37.23 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  32.6 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  32.62 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.92 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  38.54 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  29.72 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  34.52 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.07 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  33.21 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.67 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  35 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.77 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  38.91 
 
 		 303 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.97 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  35.13 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.18 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.62 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  31.56 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  37.68 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  32.88 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  30.61 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  35.04 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>