208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0182 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 		 284 aa  583  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0325  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  55.99 
 
 		 288 aa  333  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00224359  hitchhiker  9.32819e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  39.44 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  39.44 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.58 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.05 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  27.84 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  28.67 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.49 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  26.13 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.77 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  26.19 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  25.35 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.84 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  27.73 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  30.18 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  27.14 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  25.87 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  27.87 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  27.73 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  27.86 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  26.79 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  26.62 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  26.79 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  26.1 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  26.79 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  27.4 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  28.87 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  26.07 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  27.37 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  27.66 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  26.05 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  25.52 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  29.54 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  29.12 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  26.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  27.8 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.17 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  26.43 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  26.43 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  27.2 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  28.47 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  26.24 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  28.21 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  27.08 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  24.37 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  25.44 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  26.84 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  25.44 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  24.4 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  26.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  28.07 
 
 		 282 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  24.57 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  24.74 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  24.82 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  28.28 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  25.66 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  27.4 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  23.51 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  25.1 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  24.74 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  24.32 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  25.61 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  23.61 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  24.37 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  24.37 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  24.48 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  25.99 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  26.41 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  23 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  26.01 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  23.51 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  25 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  29.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.57 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  25.59 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  19.93 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  23.93 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  24.58 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  19.38 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09322  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G03450)  21.59 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133356  normal  0.645276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.74 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  24.2 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  23.71 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  26.67 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  21 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  25.86 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  23 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  24.21 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  22.81 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  29.17 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  29.05 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  24.05 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>