169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0325 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0325  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00224359  hitchhiker  9.32819e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  55.99 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  38.3 
 
 		 281 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  38.3 
 
 		 281 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  25 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  25.95 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  27.24 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  24.83 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  25.17 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  24.39 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  26.48 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  24.72 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  26.55 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  23.19 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  21.35 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.06 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  25.18 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  24.57 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  24.65 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  24.07 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  24.44 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  24.65 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  25.27 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  21.43 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  23.37 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  24.82 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  24.38 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  24.82 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  24.82 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  24.64 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  24.82 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  23.47 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  25.45 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  23.94 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.74 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  20.34 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  24.47 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  24.47 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  22.38 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  23.76 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  23.11 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  22.84 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  23.57 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  24.11 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  23.24 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  23.21 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  24.11 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  21.33 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  24.63 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  25.64 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  22.83 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  22.92 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  21.88 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  26.63 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  22.91 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  22.73 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  21.1 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  23.72 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  21.71 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  23.72 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  23.37 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  23.83 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  20.42 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  23.24 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  24.48 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  23.51 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  22.55 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  22.92 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  20.91 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.24 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  20.87 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  22.55 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  21.79 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  23.94 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.15 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  20.28 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  20.96 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  24.29 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  23.51 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  22.46 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  29.7 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  26.58 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  23.29 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.4 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  22.3 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  22.71 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  22.06 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  22.06 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  23.67 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  18.9 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  23.83 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  24.23 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>