285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2976 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  100 
 
 		 289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  73.01 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  64.06 
 
 		 283 aa  358  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  63.35 
 
 		 283 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  64.64 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  64.29 
 
 		 285 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 285 aa  349  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  64.18 
 
 		 285 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  65.4 
 
 		 294 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  64.66 
 
 		 285 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  64.56 
 
 		 297 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  62.9 
 
 		 285 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  65.93 
 
 		 284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  65.02 
 
 		 284 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  59.03 
 
 		 293 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  64.95 
 
 		 297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  59.03 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  60 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  60.42 
 
 		 285 aa  310  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  58.12 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  58.12 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  57.5 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  57.5 
 
 		 282 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  57.14 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  58.12 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  57.76 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  57.76 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  57.14 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  57.14 
 
 		 282 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  61.79 
 
 		 280 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  61.7 
 
 		 288 aa  301  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  57.04 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  57.04 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  57.04 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  57.04 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  56.07 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  57.8 
 
 		 281 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  60.95 
 
 		 286 aa  298  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  56.79 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  56.89 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  56.18 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  56.18 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  61.62 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  60.37 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  59.41 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  59.78 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  59.78 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  53.87 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  49.47 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  49.26 
 
 		 282 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  46.18 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  50.9 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  48.94 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.26 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  47.18 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  45.96 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  44.88 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  48.41 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  43.82 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  49.13 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  44.96 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  45.04 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  47.27 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  45.82 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  47.33 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  42.86 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  41.73 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  41.91 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  40.85 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  44.96 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  39.29 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  35.31 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  37.98 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  32.86 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  34.91 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  33.22 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  35.42 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  36.4 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  38.37 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  38.68 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  35.48 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  42.73 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  33.1 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  34.31 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  32.62 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  31.79 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  37.1 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  34.49 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  32.85 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  35.36 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.84 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.83 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  32.03 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.9 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  26.71 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.2 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  34.2 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.6 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>