More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2793 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  56.36 
 
 
294 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  52.41 
 
 
295 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  52.6 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  48.79 
 
 
301 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  55.27 
 
 
296 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  47.92 
 
 
289 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  42.91 
 
 
289 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  43.01 
 
 
285 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  37.15 
 
 
294 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  41.7 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  38.89 
 
 
285 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.86 
 
 
283 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  38.89 
 
 
285 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  38.89 
 
 
285 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  39.3 
 
 
283 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  42.05 
 
 
285 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  38.95 
 
 
283 aa  185  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  39.71 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  40.88 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  41.45 
 
 
303 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  39.16 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  41.42 
 
 
284 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  39.86 
 
 
281 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  40 
 
 
285 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  40.52 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  41.91 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  41.03 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  37.76 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  41.79 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  39.44 
 
 
282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  39.11 
 
 
285 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  38.33 
 
 
285 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  40.22 
 
 
290 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  38.11 
 
 
293 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  38.49 
 
 
286 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  39.85 
 
 
303 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  37.77 
 
 
286 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  40.71 
 
 
284 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  40.22 
 
 
290 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  37.41 
 
 
293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  38.89 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  39.86 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  39.51 
 
 
287 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  41.24 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  40.86 
 
 
288 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  37.77 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  37.77 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  37.41 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  37.76 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  42.35 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  37.41 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  37.41 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  42.35 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  37.72 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  35.48 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  39.41 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  38.73 
 
 
280 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  37.05 
 
 
286 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  36.27 
 
 
290 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  37.05 
 
 
286 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  36 
 
 
282 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  38.06 
 
 
282 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  36.21 
 
 
283 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  37.28 
 
 
282 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  34.86 
 
 
288 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  40.14 
 
 
294 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  41.3 
 
 
298 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  41.82 
 
 
287 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  35.11 
 
 
289 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  36 
 
 
282 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  35.64 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  35.64 
 
 
282 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  40.44 
 
 
294 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  38.15 
 
 
294 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  36.63 
 
 
281 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  35.27 
 
 
282 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  36.16 
 
 
284 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  35.34 
 
 
278 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  38.08 
 
 
287 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  35.07 
 
 
291 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  39.48 
 
 
284 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  37.24 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  36.2 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  36.16 
 
 
284 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  35.63 
 
 
285 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  37.63 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
285 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  31.93 
 
 
288 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1880  hypothetical protein  36.08 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  33.81 
 
 
287 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  32.56 
 
 
291 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  33.1 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  30.56 
 
 
294 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  35.13 
 
 
278 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.49 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  30.42 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.2 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.12 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1139  hypothetical protein  29.01 
 
 
299 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>