More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2511 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  100 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  89.97 
 
 
301 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  53.4 
 
 
295 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  55.29 
 
 
294 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  52.6 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  54.77 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  48.61 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  39.06 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  39.78 
 
 
271 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  39.78 
 
 
289 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  39.36 
 
 
285 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  38.69 
 
 
285 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  41.51 
 
 
285 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  38.85 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  37.28 
 
 
284 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  35.9 
 
 
282 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  35.36 
 
 
286 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  35.36 
 
 
286 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  35.36 
 
 
286 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  35.87 
 
 
285 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  35 
 
 
286 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  34.88 
 
 
285 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  39.72 
 
 
294 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  36.17 
 
 
282 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  35 
 
 
286 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  35.36 
 
 
286 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  34.07 
 
 
283 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  35 
 
 
286 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  35 
 
 
286 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  34.29 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  35.53 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  35.46 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.99 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  35.82 
 
 
282 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  35.53 
 
 
285 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  35.53 
 
 
285 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  35.46 
 
 
282 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  35.02 
 
 
305 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  35.46 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  33.93 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  35.21 
 
 
284 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  32.97 
 
 
283 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  36.68 
 
 
281 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  34.67 
 
 
287 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  35.66 
 
 
285 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  37.28 
 
 
285 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  35.59 
 
 
303 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  36.46 
 
 
282 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  33.45 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  36.13 
 
 
303 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  34.52 
 
 
293 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  38.17 
 
 
284 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  34.52 
 
 
293 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  36.5 
 
 
284 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  33.09 
 
 
297 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  34.67 
 
 
288 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  34.4 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  33.1 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  34.72 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  35.05 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  35.09 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  35.16 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  33.95 
 
 
281 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  31.43 
 
 
289 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  33.57 
 
 
281 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  38.46 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  33.1 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  33.45 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  34.43 
 
 
290 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  34.49 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  34.75 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  38.46 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  38.46 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  33.68 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  32.26 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  35.84 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  29.41 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  33.45 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  33.45 
 
 
297 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  32.85 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1880  hypothetical protein  34.6 
 
 
279 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  33.96 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  36.07 
 
 
298 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  34.64 
 
 
287 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.31 
 
 
282 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  29.97 
 
 
294 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  35.8 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  32.77 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  33.7 
 
 
294 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  31.1 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  35.11 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.28 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1139  hypothetical protein  31.6 
 
 
299 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  32.54 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  30.24 
 
 
291 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  35.11 
 
 
278 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.92 
 
 
282 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  29.9 
 
 
300 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.23 
 
 
292 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>