269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6399 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  100 
 
 
284 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  100 
 
 
284 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  97.18 
 
 
284 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  60.78 
 
 
283 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  59.93 
 
 
285 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  59.57 
 
 
285 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  58.66 
 
 
283 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  59.57 
 
 
285 aa  330  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  59.57 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  63.37 
 
 
284 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  58.6 
 
 
285 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  59.5 
 
 
286 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  59.5 
 
 
286 aa  310  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  59.14 
 
 
286 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  59.14 
 
 
286 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  59.14 
 
 
286 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  58.78 
 
 
286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  56.18 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  58.42 
 
 
286 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  56.74 
 
 
285 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  58.42 
 
 
286 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  58.42 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  57.19 
 
 
285 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  61.27 
 
 
284 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  59.72 
 
 
288 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  57.45 
 
 
282 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  60.71 
 
 
280 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  55.67 
 
 
282 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  56.69 
 
 
285 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  55.32 
 
 
282 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  54.64 
 
 
281 aa  291  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  56.54 
 
 
289 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  55.32 
 
 
282 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  55.32 
 
 
282 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  54.96 
 
 
282 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  57.6 
 
 
297 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  55.32 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  57.51 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  56.99 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  54.93 
 
 
294 aa  271  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  53.17 
 
 
284 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  55.83 
 
 
294 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  56.83 
 
 
303 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  52.86 
 
 
293 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  52.86 
 
 
293 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  54.55 
 
 
286 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  56.57 
 
 
298 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  48.93 
 
 
288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  54.06 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  47.7 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  51.1 
 
 
285 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  48.16 
 
 
289 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  49.12 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  49.08 
 
 
284 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  46.62 
 
 
284 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  48.03 
 
 
290 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  48.53 
 
 
303 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  47.5 
 
 
285 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  45.49 
 
 
285 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  45.58 
 
 
300 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  45.94 
 
 
287 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  48.76 
 
 
279 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  46.24 
 
 
284 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  42.96 
 
 
271 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  46.79 
 
 
285 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  50.37 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  45.49 
 
 
282 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  42.29 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  41.15 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  42.35 
 
 
291 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  40.7 
 
 
295 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  42.34 
 
 
278 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  34.81 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  38.24 
 
 
285 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  37.55 
 
 
301 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  32.98 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  40.21 
 
 
278 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  39.78 
 
 
296 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  38.06 
 
 
287 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  33.33 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  37.23 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  34.88 
 
 
287 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  31.39 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  38.91 
 
 
289 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  31.72 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.54 
 
 
284 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  38.46 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  32.73 
 
 
288 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  37.22 
 
 
281 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  36.25 
 
 
305 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  37.24 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.44 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  37.05 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  37.83 
 
 
276 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.03 
 
 
282 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
285 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  34.4 
 
 
291 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  35.65 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  35.22 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>