More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2210 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  38.62 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  34.77 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  36.49 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  36.43 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  32.87 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.56 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.02 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  34.63 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  35.61 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.92 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  34.86 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  32.1 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.15 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  35.82 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  34.07 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.37 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  35.04 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33.1 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  30.42 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  33.21 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.8 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  35.42 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.52 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  34.04 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.37 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  31.54 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  29.41 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  33.7 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  34.66 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  30 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  34.42 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  34.69 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  34.42 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  35.42 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  33.45 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.87 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  35.99 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  31.05 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  33.45 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  35.06 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  34.8 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  31.27 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.76 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  32.11 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  31.14 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  32.88 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  29.02 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.32 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  34.25 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.61 
 
 		 291 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  32.39 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  30.63 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  32.06 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  33.92 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  31.43 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  33.57 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.89 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  33.67 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  32.04 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.77 
 
 		 434 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  30.56 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.11 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.29 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  31.54 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  30.11 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  29.02 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.62 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.21 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.51 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  35.93 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  32.59 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  32.26 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  34.07 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  30.37 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  36 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  32.22 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.76 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  29.11 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  31.19 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  32.99 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  25.61 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  31.01 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  33.09 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  32.87 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.51 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  37.37 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  32.28 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.48 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.91 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  32.75 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  29.6 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  30.66 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  29.6 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.47 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>