More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2763 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  33.93 
 
 
292 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  34.39 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  34.83 
 
 
292 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  36.33 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  36.49 
 
 
281 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.22 
 
 
295 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.69 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.52 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  35.42 
 
 
584 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.39 
 
 
310 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  34.03 
 
 
281 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  34.15 
 
 
280 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  33.78 
 
 
293 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  30.56 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  32.75 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.5 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  30.82 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  34.15 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  34.69 
 
 
293 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  34.03 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  33.33 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  31.62 
 
 
271 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.14 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.99 
 
 
287 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  29.31 
 
 
292 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.98 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  32.98 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  33.67 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.03 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  35.62 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  31.38 
 
 
295 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.75 
 
 
287 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.4 
 
 
287 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.4 
 
 
287 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  30.63 
 
 
274 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.65 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.56 
 
 
351 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  34.88 
 
 
286 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.26 
 
 
271 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.64 
 
 
283 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  34.46 
 
 
292 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  28.67 
 
 
295 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.38 
 
 
287 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  31.93 
 
 
295 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.41 
 
 
291 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.14 
 
 
281 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  31.72 
 
 
289 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  31.94 
 
 
268 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.62 
 
 
273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  32.18 
 
 
273 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.63 
 
 
285 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.1 
 
 
274 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.71 
 
 
291 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.89 
 
 
302 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.32 
 
 
292 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  32.78 
 
 
279 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  34.14 
 
 
279 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.65 
 
 
279 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  31.83 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  33 
 
 
273 aa  99.4  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.22 
 
 
280 aa  99  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  31.03 
 
 
281 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.67 
 
 
298 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  29.79 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.04 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  29.53 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  29.64 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.33 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  28.37 
 
 
207 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.49 
 
 
279 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.93 
 
 
306 aa  95.5  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  32.78 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.07 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  29.41 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.45 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  32.44 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  34.02 
 
 
283 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.85 
 
 
284 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  27.46 
 
 
276 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  34.38 
 
 
280 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  30.03 
 
 
279 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  29.23 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  31.62 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.87 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  33 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  28.97 
 
 
434 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  30.66 
 
 
280 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  31.88 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  30.66 
 
 
280 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  30.66 
 
 
280 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27.59 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  27.76 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  33.57 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  28.52 
 
 
297 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  29.07 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  28.92 
 
 
298 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.14 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>