More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1716 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  100 
 
 		 298 aa  620  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.94 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  33.04 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.47 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  30.14 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  29.47 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  34.91 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  34.6 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  31.17 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.84 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.92 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.64 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  29.66 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  27.95 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.02 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.03 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.36 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.16 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.16 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  28.79 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  29.24 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  27.93 
 
 		 280 aa  89.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  29 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  26.69 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.85 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.34 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.4 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.63 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.8 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  26.19 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  29.17 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  30.52 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.36 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  29.85 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  27.31 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.69 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.65 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  28.98 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  26.6 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  27.82 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  26.95 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  28.27 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  29.95 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  24.74 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.72 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  30.59 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.4 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  26.56 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  25.27 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.67 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  26.48 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  25.26 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  24.7 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  26.62 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  26.12 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  24.07 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.24 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  24.56 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.08 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  23.59 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.5 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  28.99 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  25.52 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  25 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  25.62 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.2 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  26.21 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  27.85 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  26.52 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  25.09 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  25 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  24.89 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  31.38 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  28.1 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  27.12 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.09 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  24.57 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  26.85 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  29.24 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  30.13 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  24.74 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  24.74 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  29.24 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  25.17 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  28.51 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  26.48 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  26.1 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  35.21 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  27.09 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  25.61 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  26.69 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  27.31 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  27.31 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  27.31 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  26.25 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  27.31 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>