More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1710 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  39.01 
 
 
274 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  42.91 
 
 
294 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  38.04 
 
 
279 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  38.77 
 
 
278 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  35.4 
 
 
281 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  38.99 
 
 
283 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  38.75 
 
 
278 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  35.51 
 
 
298 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  38.01 
 
 
276 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  35.25 
 
 
281 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.93 
 
 
279 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  34.63 
 
 
287 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  38.97 
 
 
291 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  35.82 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  35.51 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  36.36 
 
 
279 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  38.81 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  32.97 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  34.86 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  35.74 
 
 
291 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  36.03 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.51 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  34.39 
 
 
280 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  31.18 
 
 
351 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  34.47 
 
 
272 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  33.7 
 
 
285 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.73 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  34.56 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  34.56 
 
 
274 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  32.87 
 
 
434 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  34.91 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  34.91 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  34.03 
 
 
284 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  32.01 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.92 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  35.79 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  35.79 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.61 
 
 
277 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  28.88 
 
 
277 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.93 
 
 
306 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.02 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  34.17 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  35.91 
 
 
268 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  32.38 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.72 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  30.47 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.66 
 
 
285 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.69 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  28.62 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  30.21 
 
 
281 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  30.25 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.11 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.24 
 
 
294 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.18 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.34 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  30.04 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  30.15 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  28.43 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  29.71 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  29.07 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  27.87 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  26.46 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  33.21 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.48 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  29.07 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.76 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  29.47 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.77 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  27.65 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.62 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  28.72 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.14 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.21 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  31.01 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  28.08 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  34.96 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  29.31 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.69 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  25.83 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  31 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  30 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  26.9 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.46 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  28.87 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  30.08 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  27.56 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  32.36 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.72 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  29.43 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  30.77 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  27.27 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  30.36 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  30.77 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.46 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.35 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  26.06 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>