252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3007 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  93.93 
 
 
280 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  48.71 
 
 
291 aa  204  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  42.48 
 
 
304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  44.65 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  47.29 
 
 
276 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  39.13 
 
 
281 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  37.91 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  37.41 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  37.15 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  34.77 
 
 
351 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  37.1 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  38.32 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  36 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  36.4 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  35.27 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  35.74 
 
 
278 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  32.25 
 
 
279 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  34.91 
 
 
279 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  37.41 
 
 
283 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  34.67 
 
 
294 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  35.14 
 
 
277 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  34.31 
 
 
434 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  34.93 
 
 
280 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  34.41 
 
 
274 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.69 
 
 
279 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  26.16 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  32.61 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  36.23 
 
 
276 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  38.77 
 
 
279 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  28.57 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.42 
 
 
281 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
276 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  35.9 
 
 
276 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.57 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  34.89 
 
 
278 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  39.21 
 
 
276 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  34.3 
 
 
284 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.18 
 
 
294 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  30.18 
 
 
272 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  34.86 
 
 
273 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  33.09 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  36.1 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  36.1 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  33.21 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  33.45 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.23 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  29.96 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  29.29 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.45 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.66 
 
 
291 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.72 
 
 
310 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.15 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  33.7 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  35.25 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  27.49 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  27.92 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.36 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.93 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.99 
 
 
285 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  30.19 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.12 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.9 
 
 
283 aa  79  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.4 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.01 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.89 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.74 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  31.54 
 
 
584 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  23.86 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.62 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  28.57 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.1 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.47 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.89 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  28.21 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  30.47 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  33.04 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  30.9 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.21 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30.07 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  27.18 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  32.88 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  25.26 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  25.26 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.5 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.04 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  30.94 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.51 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  27.44 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.22 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  25.26 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  31.51 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.53 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.41 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.03 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  29.45 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  28.35 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.93 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>