261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6618 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  100 
 
 
282 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  57.14 
 
 
281 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  53.29 
 
 
296 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  38.57 
 
 
279 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  35.71 
 
 
268 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  37.81 
 
 
283 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  36.71 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  35.92 
 
 
584 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  31.94 
 
 
273 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  33.56 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  34.28 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  38.65 
 
 
275 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  33.45 
 
 
271 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  33.69 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  34.38 
 
 
279 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  34.26 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  34.51 
 
 
280 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  40.18 
 
 
240 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.92 
 
 
280 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  33.22 
 
 
276 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  36.59 
 
 
280 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  36.84 
 
 
279 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  31.91 
 
 
274 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  33.33 
 
 
280 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  35.25 
 
 
288 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  32.08 
 
 
274 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.75 
 
 
310 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  29.18 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.98 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.73 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  32.76 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.45 
 
 
299 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.97 
 
 
434 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.41 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  32.65 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.08 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  32.54 
 
 
280 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  33.45 
 
 
295 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  33.57 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.06 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.31 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  35.59 
 
 
274 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  32.88 
 
 
280 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  32.88 
 
 
280 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.64 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  29.47 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  31.88 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.45 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  31.43 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.14 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.29 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  31.49 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.36 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.6 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  28.67 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.54 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.51 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.61 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  28.67 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.27 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  30.64 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.88 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.65 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  30.14 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  33.33 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  30.39 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.1 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  26.57 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  31.69 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.36 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  28.77 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  31.71 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.13 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  26.69 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  26.1 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.04 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  31.8 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.33 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  32.34 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00992  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01860)  26.07 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  29.32 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.33 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.62 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.6 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  28.24 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  29.19 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  32.36 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  23.08 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47077  predicted protein  24.43 
 
 
328 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0255918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  31.34 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.24 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  28.37 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  40.41 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  30.1 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.47 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.47 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>