More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0483 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  34.9 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  33.22 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  33.78 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  33.9 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.45 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  30.53 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  35.07 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.53 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.11 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.76 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  31.51 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  28.82 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.93 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  31.08 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  29.76 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  29.39 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  33.79 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.82 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  31.1 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.93 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  29.31 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  29.31 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.1 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  29.31 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.87 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  28.97 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  30.56 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  30.21 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.27 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.03 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.03 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.55 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  29.51 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  29.51 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.65 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  30.92 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  32.14 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  37.15 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  29.51 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  29.86 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  29.86 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  29.21 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  31.36 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.87 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.61 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  28.43 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.3 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  30.53 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  32.13 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  29.31 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.03 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  27.03 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  31.01 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.9 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  33.2 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  28.62 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  32.29 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  29.68 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  31.88 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  28.12 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.69 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.11 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.35 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  32.78 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  30.88 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  29.93 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  29.55 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  34.8 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  31.71 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  29.55 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.1 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  30.95 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  34.91 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  31.34 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  34.38 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  32.95 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  26.44 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  31.35 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.76 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  29.79 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  30.93 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  30.93 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  33.22 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.6 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  29.39 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  30.61 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  31.32 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  27.4 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  27.34 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  28.67 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  26.44 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  28.17 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  27.96 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  28.27 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.53 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  28.18 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>