282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6067 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  100 
 
 		 295 aa  587  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.9 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.82 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.75 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.63 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.48 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.38 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.58 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.33 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  34.66 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  34.49 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  29.26 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  30.31 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  30.74 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  30.88 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  32.97 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.8 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  31.18 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.17 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.14 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  31.18 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  30.82 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  29.66 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  30.82 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  30.18 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  30.18 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  30.53 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  30.56 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  30.18 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  30.82 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  30.32 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  34.77 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.57 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.47 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  30.82 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  30.8 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  30.14 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.21 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  28.92 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  28.92 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  28.92 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  29.47 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  28.95 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  32.96 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  30.51 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  33.69 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  32.96 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.7 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.99 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  28.72 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  28.32 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.93 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  31.5 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  28.52 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30.66 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  30.77 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  31.48 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  31.02 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  31.23 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.13 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.13 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  29.68 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  28.47 
 
 		 584 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.42 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.57 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.94 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  28.92 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.86 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  31.41 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  31.25 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.37 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1880  hypothetical protein  28.07 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  27.82 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  31.37 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  28.93 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.82 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.77 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.54 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  29.25 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  28.12 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  30.88 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  30.04 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  29.26 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.2 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  28.04 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  28.57 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  29.64 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  26.71 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  30.68 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  30 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  31.54 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  30.5 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  28.62 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>