286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05352 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  557  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1880  hypothetical protein  51.6 
 
 		 279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  39.58 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  34.68 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  36.18 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  34.27 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  32.47 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  31.58 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.4 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  33.22 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  34.49 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  29.82 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  31.39 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  36 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  30.82 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  33.33 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.05 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  32.74 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  30.96 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  35.52 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  34.17 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  30.58 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  32.87 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  34.44 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.16 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  30.88 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  31.25 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.88 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  33.57 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  32.38 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  33.58 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  32.14 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  32.61 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  32.73 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  32.73 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  31.6 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  25.25 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  31.88 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  33.21 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  34.62 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  33.33 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  33.88 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  33.47 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  31.52 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  26.9 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  30.22 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  31.52 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  26.9 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  31.52 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  31.65 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  33.1 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  28.47 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  33.33 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  34 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.87 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.66 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.67 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.43 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.54 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  33.22 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.82 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  31.29 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.33 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.77 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  30.17 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  23.96 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  23.96 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  27.68 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  30.14 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  29.67 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  31.32 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  29.68 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  30.66 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  27.5 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  32.99 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.96 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.97 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  29.62 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.18 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  34.36 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  33.45 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  31.4 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.64 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  32.76 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  33.92 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  34.19 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  32.5 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.85 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  33.92 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  28.57 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  32.64 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>