More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1047 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  57.48 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  48.54 
 
 		 286 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.76 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  43.8 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  45.33 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  47.99 
 
 		 276 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  45.42 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  51.54 
 
 		 358 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  41.67 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  44.83 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  32.41 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33.9 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  31.58 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  31.9 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  37.45 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  29.72 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  34.05 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.28 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.17 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  34.42 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  34.5 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  34.2 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  30.63 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  32.31 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  33.77 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  31.8 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.62 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  34.51 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.03 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.21 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  34.29 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 285 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  34.03 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  34.62 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  34.29 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.93 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  33.93 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  34.62 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  31.8 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.86 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  34.27 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  34.31 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  33.45 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  34.27 
 
 		 282 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.44 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  33.93 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  33.93 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  32.59 
 
 		 297 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  29.45 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.74 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.54 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  33.57 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  32.49 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  30.15 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  28.72 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  32.13 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  32.13 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  32.13 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  35.92 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  34.65 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  32.03 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  33.57 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.89 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  32.86 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  32.5 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  29.18 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.12 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.9 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.11 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  35.51 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  31.93 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  32.6 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  32.97 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  26.64 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  31.54 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  28.92 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25.38 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  30.34 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  28.32 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  30.55 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.17 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  32.37 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  33.05 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  29.83 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.43 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  32.59 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  31.27 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  29.97 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  28.18 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  27.62 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  31.88 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.67 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.8 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  32.23 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.23 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  28.4 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  27.46 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>