More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3320 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  100 
 
 		 295 aa  558  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  52.01 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  50.5 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  50.88 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  51.97 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  50.53 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  47.86 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  52.14 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  48.6 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  44.83 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  51.87 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  36.24 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.28 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  32.54 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.1 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  32.87 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  34.39 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  29.1 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  37.67 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  31.91 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  36.25 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  33.92 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  36.46 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  32.62 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  39.47 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  28.47 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  32.62 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  32.62 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  33.04 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  37.18 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  34.58 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  32.62 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  32.62 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  32.16 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  35.9 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  31.9 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  32.16 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  34.16 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  32.16 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  31.9 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  32.17 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  31.8 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  31.97 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  35.25 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  31.8 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  31.9 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  31.9 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  33.2 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  33.1 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  32.49 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  32.79 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  35.19 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  36.84 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.56 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.72 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  39.01 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  35.96 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  35.07 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  40.07 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.5 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  33.45 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  35.66 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.39 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.17 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  35.21 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.07 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  30.66 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.08 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.68 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  34.98 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  33.91 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  31.79 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  31.82 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.74 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1918  NmrA family protein  35.54 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.838838  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  33.33 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  37.04 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  31.03 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  32.85 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  33.57 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.34 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  38.33 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  34.75 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  35.4 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  29.9 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  34.74 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  34.4 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.97 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  31.45 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.45 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.38 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  34.24 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  33.91 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.56 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.69 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  35.89 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.82 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>