More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4764 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  99.29 
 
 
282 aa  563  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  98.58 
 
 
282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  98.58 
 
 
282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  98.58 
 
 
282 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  80.58 
 
 
286 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  80.22 
 
 
286 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  80.22 
 
 
286 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  80.58 
 
 
286 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  80.22 
 
 
286 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  79.14 
 
 
286 aa  424  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  80.22 
 
 
286 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  80.22 
 
 
286 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  78.37 
 
 
286 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  76.6 
 
 
282 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  64.18 
 
 
283 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  63.48 
 
 
283 aa  360  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  64.89 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  64.54 
 
 
285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  64.54 
 
 
285 aa  353  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  61.7 
 
 
285 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  62.63 
 
 
280 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  63.97 
 
 
284 aa  324  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  58.51 
 
 
285 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  58.16 
 
 
281 aa  314  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  64.39 
 
 
284 aa  311  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  59.93 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  58.66 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  57.14 
 
 
289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  57.56 
 
 
297 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  59.93 
 
 
288 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  56.99 
 
 
285 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  57.66 
 
 
285 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  56.38 
 
 
284 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  58.93 
 
 
294 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  55.32 
 
 
284 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  55.32 
 
 
284 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  54.35 
 
 
293 aa  275  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  54.35 
 
 
293 aa  275  6e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  51.6 
 
 
281 aa  274  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  58.3 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  54.51 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  50.88 
 
 
284 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  53.68 
 
 
290 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  53.68 
 
 
290 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  49.82 
 
 
282 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  48.04 
 
 
288 aa  252  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  53.51 
 
 
294 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  48.75 
 
 
284 aa  241  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  51.1 
 
 
303 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  51.65 
 
 
298 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.64 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  47.35 
 
 
287 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  47.83 
 
 
285 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  41.61 
 
 
289 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  46.43 
 
 
290 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  44.17 
 
 
285 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  44.8 
 
 
285 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  43.26 
 
 
284 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  43.77 
 
 
303 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  45.49 
 
 
285 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  44.73 
 
 
271 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  44.93 
 
 
300 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  44.24 
 
 
282 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  36.07 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  44.57 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  46.35 
 
 
287 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  38.75 
 
 
294 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  41.79 
 
 
284 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  38.93 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  39.16 
 
 
287 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  39.43 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  36.81 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  33.8 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  36.2 
 
 
281 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  35.42 
 
 
287 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  34.75 
 
 
283 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  35.94 
 
 
301 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  34.98 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  35.27 
 
 
291 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  32.16 
 
 
291 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  35.46 
 
 
302 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  35.59 
 
 
285 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  35.79 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  34.04 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  37.59 
 
 
296 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.89 
 
 
305 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  36.96 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.48 
 
 
282 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  32.98 
 
 
288 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.43 
 
 
282 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  35.23 
 
 
287 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  29.27 
 
 
306 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  32.62 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  32.62 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.31 
 
 
295 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.27 
 
 
292 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.54 
 
 
273 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  31.58 
 
 
288 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>