More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3935 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  50.54 
 
 
292 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  49.48 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  35.42 
 
 
292 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  38.62 
 
 
281 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.39 
 
 
291 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  34.9 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  32.99 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  34.01 
 
 
273 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.81 
 
 
310 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  31.36 
 
 
284 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.17 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.02 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.99 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.03 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.19 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.04 
 
 
295 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  30.48 
 
 
295 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.63 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  29.79 
 
 
434 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.27 
 
 
283 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  32.17 
 
 
273 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  30.18 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.12 
 
 
289 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  31.62 
 
 
297 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  31.94 
 
 
298 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  32.07 
 
 
299 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  31.1 
 
 
273 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  29.27 
 
 
291 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.47 
 
 
301 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.58 
 
 
271 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.84 
 
 
283 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  31.4 
 
 
284 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.45 
 
 
274 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.39 
 
 
289 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32.26 
 
 
250 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.79 
 
 
290 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  34.14 
 
 
295 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  27.84 
 
 
288 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.99 
 
 
351 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  29.9 
 
 
292 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  31.99 
 
 
280 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  32.88 
 
 
292 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  28.01 
 
 
285 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  26.32 
 
 
291 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  31.44 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.45 
 
 
282 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  30.21 
 
 
291 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  32.43 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  29.08 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.52 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  32.51 
 
 
280 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  28.57 
 
 
277 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.47 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  31.56 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  29.27 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.85 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  32.27 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  29.9 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  28.72 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.19 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  30.89 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.51 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  29.69 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  28.27 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  29.56 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.85 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  29.97 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.69 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.85 
 
 
287 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.88 
 
 
584 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  29.79 
 
 
292 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  31.7 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  32.17 
 
 
276 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.25 
 
 
306 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  28.27 
 
 
285 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  31.73 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.41 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  29.02 
 
 
281 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  28.52 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  27.92 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.94 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  28.74 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.41 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  31.23 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  29.64 
 
 
297 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  29.51 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  31.45 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  31.45 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  28.18 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.43 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  31.7 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  30.15 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.19 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.35 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  31.39 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.07 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.07 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  30.15 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  30.77 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>