More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3020 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  79.09 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  59.23 
 
 		 289 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  59.64 
 
 		 290 aa  342  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  59.29 
 
 		 290 aa  341  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  58.16 
 
 		 287 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  57.8 
 
 		 287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  57.8 
 
 		 287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  55.75 
 
 		 293 aa  325  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  56.58 
 
 		 287 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  56.23 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  50 
 
 		 293 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  50 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  46.62 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.6 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.12 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  37.84 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  36.6 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  30.27 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.72 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  32.3 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.97 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  32.17 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.11 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.9 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.7 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  38.96 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.25 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.23 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.25 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  29.37 
 
 		 299 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  34.27 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.85 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  31.98 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.86 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  31.53 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.28 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  34.55 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  35.47 
 
 		 584 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  35.59 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.22 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.76 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  28.17 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  30.82 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  32.21 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  34.05 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.96 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.46 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  30.54 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.03 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.18 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.06 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.56 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  31.58 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.48 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.28 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  33.16 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.03 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.19 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  31.86 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.42 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.63 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  30.77 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.25 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.62 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.02 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  25.16 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.27 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  30.03 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  33.18 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  32.74 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  31.6 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  28.57 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  28.33 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.85 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.34 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.24 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  34.01 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  37.58 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  32.48 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  30.03 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  29.3 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.59 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  30.61 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  31.41 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.04 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  28.42 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  38.82 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  29.15 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  29.45 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.89 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.18 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.51 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  35.39 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  25.96 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  25.76 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>