More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2191 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  100 
 
 		 290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  48.94 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  48.28 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  41.4 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  41.97 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  49.3 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  43.43 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  44.06 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  41.58 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  43.97 
 
 		 450 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  44.37 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  37.94 
 
 		 300 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  44.25 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  41.55 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  37.31 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  41.49 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  37.14 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  29.45 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  29.45 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  36.33 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  40.24 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  37.56 
 
 		 226 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.93 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  32.17 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  29.07 
 
 		 345 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.48 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  34.71 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  34.78 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  35.16 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  35.44 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  35.44 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  32.85 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  30.1 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  33.55 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  30.58 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  34.19 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  28.39 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  32.14 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  35.34 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  35.65 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  27.91 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  32.69 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.48 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  34.35 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.91 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.33 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  32.76 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33.62 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33.62 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  33.62 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  32.57 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  38.89 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  31.3 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  32.58 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.9 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  31.47 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  34.05 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.57 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11740)  30.04 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  35.37 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  33.88 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  34.78 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.73 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  28.98 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.97 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  38.1 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.46 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  30.43 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  28.1 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  33.33 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.76 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  30.72 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08168  Nitrogen metabolite repression regulator NmrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59919]  27.74 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0063095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  29.91 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  30.37 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  33.91 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  33.91 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  34.2 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  30.4 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  32 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.29 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.87 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  29.73 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29.44 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  28.73 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  32.8 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  34.93 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  27.64 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  28.46 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>