More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3810 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  42.86 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  42.42 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  38.79 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  41.4 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  40.61 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  41.67 
 
 		 290 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  36.43 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  40.91 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  34.88 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  38.53 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  39.15 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  34.66 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  33.95 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  33.45 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  34.39 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  34.39 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  36.29 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  34.59 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  37.1 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  32.74 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  35.22 
 
 		 450 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  29.71 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  33.21 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  30.56 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.51 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  29.54 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  29.24 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.6 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  41.61 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  36.25 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  32.1 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  30.58 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  30.58 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.34 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.39 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  30.82 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.18 
 
 		 345 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.22 
 
 		 345 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  31.51 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  38.41 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.93 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.93 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  29.82 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.66 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.67 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.31 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  31.03 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  30.36 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.75 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  28.32 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  38.96 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  37.2 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.31 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.51 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  36.67 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  29.87 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.76 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.41 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.24 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  33.18 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.6 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  32.89 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  30.52 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.64 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  28.99 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  35.57 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  29.44 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  27.66 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  29.13 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.88 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  27.9 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  30.33 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  28.92 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  30.61 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  30.08 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  28.83 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  34.67 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2314  NmrA family protein  30.42 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  34.67 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06780  expressed protein  24.65 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  32.24 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  28.94 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  26.92 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  28.86 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  34.9 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  30.45 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  30.87 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  29.49 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  28.95 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  28.87 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.85 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>