More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6636 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  55.25 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  50.17 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  47.59 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  48.58 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  44.9 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  48.28 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  41.42 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  38.85 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  42.97 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  35.92 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  37.77 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  29.23 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  29.23 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  34.66 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  33.33 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  35.59 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  39.62 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  37.59 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  38.21 
 
 		 450 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  30.83 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  32.04 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  27.67 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  31.06 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.24 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.77 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  28.71 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.08 
 
 		 345 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  31.52 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 343 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  33.19 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  32.8 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  25.66 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  31.41 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  31.72 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  29.04 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  31.72 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  32.48 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.37 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  29.49 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  30.82 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  32.07 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  32.13 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  36.07 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  36.07 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  36.48 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  33.48 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  34.01 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  36.65 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  31.07 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  34.78 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  40.88 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  36.13 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  34.48 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.71 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.08 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.54 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.73 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  28.1 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  32.96 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  38.93 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  39.87 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  34.32 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.55 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  38.93 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  33.2 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  36.44 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  38.31 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.81 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  35.29 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.08 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  32.22 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.17 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.76 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  34.35 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  32.35 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  33.19 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  32.68 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  32.17 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  39.22 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  30.61 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  30.94 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  36.71 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  30.66 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  33.12 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11740)  26.27 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  33.17 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  33.33 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  34.17 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.17 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>