More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4150 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  52.5 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  44.57 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.44 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  43.71 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  39.86 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  39.51 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  40.77 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  39.86 
 
 		 584 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  38.68 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.68 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  31.23 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  37.76 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  36.52 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.79 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.17 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  32.87 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  36.75 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  32.99 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  39.22 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  40.16 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  36.62 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  37.5 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  37.25 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  33.92 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.15 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  34.4 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.82 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  34.75 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  34.59 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  33.57 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.86 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  34.48 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  35.69 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  34.24 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  34.27 
 
 		 434 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  39.5 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  34.14 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  35.21 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  33.94 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  34.97 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  33.33 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  30.04 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  35.02 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  33.33 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  34.95 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  35.11 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  33.09 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  32.97 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  33.45 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.1 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  33.33 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  33.21 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  35.56 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.33 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  35.19 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  33.22 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  32.98 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  35.02 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33.56 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.92 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  32.5 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.67 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  33.94 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.86 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.86 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  32.03 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.09 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.2 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.26 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.9 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.56 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  33.11 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  32.74 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  35.59 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.29 
 
 		 294 aa  88.6  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  33.57 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  30.85 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  34.93 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  35.76 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  35.27 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  27.67 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  33.92 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  35.42 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  30.94 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  28.11 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.27 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  30.93 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  29.41 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.14 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.37 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  28.47 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  28.4 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  34.17 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  30.87 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  31.48 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  31.03 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>