237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2092 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  62.33 
 
 		 299 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  50.67 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  48.67 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  48.83 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  47.83 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  47.14 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  43.75 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  41.47 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  39.74 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  41.58 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  36.88 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  39.54 
 
 		 295 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  38.08 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.09 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.15 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  28.78 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.84 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.59 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.67 
 
 		 280 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  26.24 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  27.87 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  27.18 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  30.59 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  27.16 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  24.54 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  26.33 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.24 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  27.24 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  26.89 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  25.44 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  28.63 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  28.14 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  26.22 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  23.02 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  25.54 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  23.15 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  27.75 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  21.26 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  26.92 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.15 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  28.43 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  23.05 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  23.25 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.79 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.73 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  25.26 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  27.44 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  27.69 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  25.54 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.41 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  22.68 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  25 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.42 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  26.29 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  24.58 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  25.71 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  24.27 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  26.83 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  30.77 
 
 		 482 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  24.81 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  26.64 
 
 		 226 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  28.46 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.81 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  24.26 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  25.37 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  23.08 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  24.43 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 478 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  26.71 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  22.85 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  25.09 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  22.73 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  23.11 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  25.1 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.77 
 
 		 477 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.81 
 
 		 476 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 476 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  39.71 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 440 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  22.14 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 440 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 440 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.77 
 
 		 477 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.77 
 
 		 477 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.81 
 
 		 476 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.81 
 
 		 476 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>