More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2828 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  100 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  56.29 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  39.93 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  36.29 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  39.62 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  36.49 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  40.64 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  36.79 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  38.17 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.88 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  33.44 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  37.5 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  40 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  28.33 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  28.33 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  36.33 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  35.51 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  30.23 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  33.33 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  36.1 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  30.65 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  32.67 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  27.22 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  30.89 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  26.78 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.74 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  26.36 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.87 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  25.08 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  28.16 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  31.58 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.18 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.6 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.92 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  27.6 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.26 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  33.96 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.92 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  36.17 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  32.56 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  24.92 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  30.54 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  34.08 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  29.5 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.13 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.35 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.97 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.37 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.37 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  31.38 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  27.7 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.45 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  28.53 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.52 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.2 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  23.87 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.21 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  30.9 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.5 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  26.48 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  34.11 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.48 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.71 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  26.14 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  31.98 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.8 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  30.34 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  33.5 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.1 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  41.74 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  28.63 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  25.63 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  26.88 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  25 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  28.8 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  37.82 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  48.72 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  48.72 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  27.19 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.12 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  34.55 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.43 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  26.49 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  37.9 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  33.49 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  31.25 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  35.94 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  24.53 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>