199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5281 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  34.59 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  36.94 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  35.99 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  37.46 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  37.02 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  39.15 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  36.21 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.27 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  33.21 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  37.41 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  33.98 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  37.37 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  37.37 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  33.22 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  33.22 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  37.41 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  33.45 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  31.51 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  32.06 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  31.03 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  30.69 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  32.62 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  37.12 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  29.51 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  36.03 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  31.36 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  31.01 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  33.77 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  34.39 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  35.96 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.8 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  29.04 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  30.34 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  30.58 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  30.58 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  30.08 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.85 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  31.09 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  24.19 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  26.24 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  29.63 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.51 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  29.5 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  28.8 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.86 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.67 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.15 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  24.72 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  25.52 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.69 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  25.59 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  30.99 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.33 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  37.8 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  23.05 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  27.11 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  26.46 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  30.15 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  28.8 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.85 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.1 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.77 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.22 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  32.43 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  24.81 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.89 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.89 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  31.71 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  26.57 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.63 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  32.89 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.46 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.35 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.35 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  31.77 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  29.79 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  31.38 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  29.33 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  29.22 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.73 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  24.91 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  25.84 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  26.49 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  26.52 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  26.92 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  22.92 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.2 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  25.1 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  28.87 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  28.3 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.86 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  24.61 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.76 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  26.24 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.76 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  27.98 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.27 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>