84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1674 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  86.71 
 
 
307 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  58.28 
 
 
295 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  58.97 
 
 
295 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  58.62 
 
 
296 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  58.62 
 
 
296 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  58.62 
 
 
295 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  57.59 
 
 
293 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  58.97 
 
 
297 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  58.97 
 
 
297 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  57.24 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  55.71 
 
 
293 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  46.28 
 
 
300 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  45.55 
 
 
292 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.7 
 
 
286 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  34.36 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  35.84 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  33.45 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  34.81 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  34.81 
 
 
288 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  34.81 
 
 
288 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  34.81 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  36.52 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  36.18 
 
 
288 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  36.18 
 
 
288 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.74 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  29.55 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  34.56 
 
 
285 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  24.83 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  32.27 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  31.23 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  25.29 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  28.77 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  31.56 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  29.9 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  24.54 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  23.91 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  26.57 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  24.25 
 
 
296 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.57 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.24 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.28 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  26.34 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  21.45 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.89 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  22.66 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  27.31 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  24.16 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  24.41 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  22.76 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  29.34 
 
 
289 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  26.67 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  29.24 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.76 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  34.35 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  27.05 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  35.42 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  25.34 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  23.77 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  26.27 
 
 
124 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.95 
 
 
291 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  27.23 
 
 
280 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  27.17 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  24.14 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  23.68 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  36.78 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  38.36 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  41.18 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.75 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.72 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  24.83 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  27.78 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  43.84 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  25.94 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  29.5 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.72 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  37.1 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  22.18 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  23.64 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  38.03 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  25.39 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>