More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6112 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  94.79 
 
 		 288 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  88.19 
 
 		 288 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  88.54 
 
 		 288 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  86.46 
 
 		 288 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  86.46 
 
 		 288 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  77 
 
 		 288 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  77.08 
 
 		 287 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  64.34 
 
 		 287 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  61.46 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  57.54 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  60.7 
 
 		 285 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  35.99 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  37.33 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  37.33 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  36.05 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  35.64 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  35.05 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  35.81 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  28.77 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  33.92 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  33.1 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  34.05 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  34.81 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  37.77 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  34.35 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  35.02 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  28.92 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  39.52 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  47.24 
 
 		 130 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  35.15 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  35.27 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  35.27 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  38.71 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.94 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.41 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  33.19 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  27.18 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  33.48 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  32 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  25.08 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  27.89 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  29.33 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  28.82 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  31.88 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  36.28 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.03 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.11 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  30.17 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  29.84 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  26.34 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.63 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  31.3 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  33.19 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  29.61 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.43 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  29.53 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  35.16 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  31.8 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.91 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.91 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  30.4 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  26.55 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  30.65 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  31.58 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  29.17 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.99 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.07 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.52 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  27.95 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  29.83 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.05 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  32 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  29.05 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  31.39 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  31.6 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.49 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.11 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  30.71 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.98 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.89 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.97 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  28.38 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  31.43 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.87 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  30.73 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  32.14 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  23.26 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  25.1 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.03 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.41 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  26.72 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  30.67 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.02 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  27.8 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.53 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.02 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  26.09 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  29.13 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>