91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3245 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  100 
 
 		 295 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  96.27 
 
 		 295 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  83.05 
 
 		 295 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  81.63 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  81.63 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  79.32 
 
 		 316 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  73.76 
 
 		 293 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  60.75 
 
 		 296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  60.75 
 
 		 296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  58.97 
 
 		 299 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  56.99 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  53.77 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  47.55 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  42.27 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  29.9 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  33.56 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.79 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  32.99 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  33.69 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  31.03 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  33.1 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  33.11 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  32.99 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.16 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  29.39 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  29.37 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  32.3 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  32.3 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  32.52 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  29.37 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  31.7 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  29.69 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  32.39 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  27.02 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29.08 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  30.14 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  27.03 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  50 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  27.94 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  24.9 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  21.84 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  23.53 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.25 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  22.53 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.15 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  22.93 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  33.07 
 
 		 130 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  28.05 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  27.95 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  24.42 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  24.35 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.83 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  27.2 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  26.63 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  24.43 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  40 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  23.43 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  23.75 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  46.27 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  26.76 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  25.95 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.1 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  22.03 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  39.06 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.78 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.57 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  40.85 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.86 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  44.78 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  33.33 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  32.29 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  24.34 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.07 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  23.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  37.5 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  24.91 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  26.06 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  23.74 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  23.37 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.05 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  33.85 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  24.16 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  25.83 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  40.35 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  36.92 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 		 212 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>