299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3897 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  100 
 
 		 313 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  37.5 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  30.1 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  31.06 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  28.98 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.59 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.74 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  30.74 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  27.8 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  29.07 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  30.5 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  30.07 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  28.29 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  28.57 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  27.15 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  28.62 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  32.07 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  27.42 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  26.42 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  27.76 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  29.92 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  27.88 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.82 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  26.99 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.24 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  26.99 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  28.24 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  26.97 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  28.14 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  27.18 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  28.29 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  25.29 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  24.45 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  27.55 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  25.44 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  22.44 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  28.74 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.69 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  24.82 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  24.9 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  27.03 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  28.86 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.49 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.6 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.95 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  24.15 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  26.21 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.32 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  27 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.05 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  27.98 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.88 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  28.76 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  27.03 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  23.4 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  24.1 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  24.62 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  27.99 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  23.6 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.89 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.03 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  25.69 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  27.16 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  27.16 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  27.63 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.57 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  23.64 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.91 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  24.71 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  25.59 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  23.55 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  28.33 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  24.14 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  24.81 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  27.63 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  25.7 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  27.45 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  24.8 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  27.2 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  26.96 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  22.69 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.67 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  24.48 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  27.11 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  26.62 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  25.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  22.97 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.21 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  25.38 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.97 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  29.59 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  25.38 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  24.17 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  29.15 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  24.42 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  33.77 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>