161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0196 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  100 
 
 		 295 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  53.06 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  48.82 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  47.12 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  44.56 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  44.44 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  45.24 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  43.55 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  39.12 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  38.93 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  40.2 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  38.93 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  39.54 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  37.78 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  32.89 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.74 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  30.07 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  30.18 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  28.51 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.75 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  26.48 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  29.08 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  26.71 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  24.31 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  25.55 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  27.9 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  28.14 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.46 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.91 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.07 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.07 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  25.48 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  25.91 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  24.81 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  28.95 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.6 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  26.57 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  27.19 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  25.88 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.72 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  28.57 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  26.46 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.11 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  22.19 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  24.12 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  28.44 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  27.8 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  27.11 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  24.57 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  26.58 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  26.56 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  27.27 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  25.11 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.57 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  25 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  26.19 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  26.57 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  25.78 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  28.14 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.64 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  26.32 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  25.78 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  26.32 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  23.97 
 
 		 584 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.1 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  24.54 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.78 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  25.4 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  24.63 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  26.43 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  27.22 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  21.93 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.43 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  26.1 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  25.59 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  26.64 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  24.3 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  28.05 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  25.76 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  25.83 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  22.85 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  24.48 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  28.05 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  28.05 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  25.79 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  29.02 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  27.27 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  31.09 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  24.08 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  25.43 
 
 		 450 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  24.32 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  25.88 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  28.05 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.99 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  25.45 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  22.22 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>