83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0241 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  36.63 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  37.09 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  37.25 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  36.95 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  38.28 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  36.49 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  33.88 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  31.19 
 
 		 319 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  33.11 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  31.21 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  34.22 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  33.78 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  30.74 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  31.03 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  25.14 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.8 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  25.95 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.14 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.28 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.36 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  26.83 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.29 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  26.32 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  25.21 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.44 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  24.47 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  26.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  26.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  26.02 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  22.22 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  25.61 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  26.73 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  22.71 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  25.61 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  26.67 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  28.8 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  23.56 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  25.1 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  27.87 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  26.51 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  25.17 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  28.89 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  22.94 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  42.65 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0239  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000144523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  23.95 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  25.6 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  40.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.51 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  27.21 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  26.49 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  45 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  40.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  26.9 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  40.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  27.21 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.76 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  23.41 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.82 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2130  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.19 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  26.67 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  24.83 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>