210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0114 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
293 aa  597  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  40.77 
 
 
290 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  37.85 
 
 
287 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  38.89 
 
 
288 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  42.56 
 
 
285 aa  188  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  33.8 
 
 
312 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.87 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  39.78 
 
 
287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  37.67 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  37.5 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  33.8 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  36.81 
 
 
285 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  37.72 
 
 
288 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  37.37 
 
 
288 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  37.37 
 
 
288 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  37.08 
 
 
288 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  40.15 
 
 
288 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  35.56 
 
 
300 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  34.65 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  33.8 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  33.8 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  33.68 
 
 
300 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  31.56 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  32.68 
 
 
292 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  31.9 
 
 
292 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  31.85 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  31.48 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  32.85 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  30.28 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  32.63 
 
 
299 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  30.41 
 
 
295 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  29.68 
 
 
307 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  30.21 
 
 
297 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  30.21 
 
 
297 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  29.63 
 
 
316 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  26.46 
 
 
313 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  24.81 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  27.15 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  25.85 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  30.89 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  28.36 
 
 
292 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  25.84 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  28.79 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.34 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  29.66 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  26.59 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27.34 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  23.79 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  25.85 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  42.06 
 
 
130 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  28.4 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  23.32 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.37 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  29.94 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  32.26 
 
 
124 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  27.88 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  31.52 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  22.14 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  24.48 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  25 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  25.61 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.19 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.97 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.97 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  26.77 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  26.94 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  30.2 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  27.61 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.17 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  24.14 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  26.29 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  27.6 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.59 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  25.84 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  26.46 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  28.63 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  28.04 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  22.09 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  25.54 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  25.68 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  24.17 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  32.21 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.11 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  27.51 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.76 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  24.4 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  27.17 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  30.82 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  24.9 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  24.19 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  24.24 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  27.31 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  26.52 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  26.72 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.88 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.07 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.07 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  29.44 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  28.29 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>