More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4267 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  100 
 
 		 292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.83 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  47.93 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  45.17 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  32.53 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27.3 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  33.11 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.74 
 
 		 313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  31 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  29.59 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.6 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  29.85 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  29.34 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.92 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  27.38 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  27.71 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  29.92 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  26.62 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  27.8 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.83 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.74 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  30.16 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.96 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.84 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  29.6 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.45 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.3 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.1 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  26.98 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  25.95 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  26.71 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  26.42 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.33 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  27.09 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.12 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  29.31 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.19 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  22.86 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  27.02 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  23.88 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.17 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  29.11 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.32 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.47 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  29.82 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.94 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.83 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  27.76 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.17 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  30.04 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.75 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  29.17 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  26.22 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  30.93 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  25.58 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.6 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  26.47 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  28.62 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  31.8 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.59 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.28 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.92 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  27.34 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  26.96 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.33 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  25.21 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  27.9 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  28.47 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  27.9 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.45 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.45 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  30.42 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30.16 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.17 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  29.55 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.45 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.09 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  31.36 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.44 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.63 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  29.04 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.92 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  32.05 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  24.81 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  30.47 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.66 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  28.72 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.09 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  27.05 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  30.14 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  25.71 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  28.69 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  28.63 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  28.83 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  32.31 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  28.26 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>