220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1014 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  100 
 
 
300 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  82.46 
 
 
288 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  51.97 
 
 
286 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  48.07 
 
 
292 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  34.14 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  35.66 
 
 
290 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  34.39 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  32.42 
 
 
287 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  49.19 
 
 
124 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  36.59 
 
 
288 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  33.46 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  37.12 
 
 
288 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  34.52 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  36.59 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  38.27 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.87 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  38.31 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  32.18 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  35 
 
 
300 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  36.18 
 
 
288 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  37.8 
 
 
288 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  37.8 
 
 
288 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  31.54 
 
 
295 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  35.84 
 
 
288 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  32.93 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  32.93 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  31.33 
 
 
295 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  31.7 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  31 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  29.9 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.8 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  34.24 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  29.66 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  31.68 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  26.2 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.73 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  31.31 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  24.9 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  25.7 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  28.78 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  31.08 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  31.08 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  24.5 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  26.7 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  26.05 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.88 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.47 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  24.79 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  28.57 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  29.91 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.28 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.28 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.84 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  31.72 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  31.3 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  27.53 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.18 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  31.71 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.08 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.03 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  31.39 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.57 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  30.64 
 
 
274 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  26.14 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46721  predicted protein  28.01 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  25 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.91 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.44 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  32.33 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  22.57 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  27.22 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  22.34 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  22.34 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  28.95 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.67 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  22.65 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.1 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  29.36 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  32.7 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  28.62 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  26.34 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  35.85 
 
 
510 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  29.85 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.44 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  30.8 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.95 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  22.11 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  27.44 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  27.51 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  27.61 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  28.08 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  23.29 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  25.67 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  28.01 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  29.41 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  27.95 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.02 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  26.52 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>