More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3888 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  47.59 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  41.14 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  40.61 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  39.25 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  44.37 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  40.07 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  46.55 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  38.23 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  39.36 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  37.1 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  39.38 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  36.33 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  33.12 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  34.84 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  37.69 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  36.12 
 
 		 450 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  37 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  37 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  26.86 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  26.86 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  36.78 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  31.66 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  32.6 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  29.93 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  31.21 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  33.11 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  37.18 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  27.51 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.61 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  35.32 
 
 		 226 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  29.28 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.83 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  31.94 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  31.8 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  26.5 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  31.69 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.92 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  34.66 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.49 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  34.8 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  29.21 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.68 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  41.73 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  31.58 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  31.02 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  28.57 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  32.13 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  29.41 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  34.16 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  32.91 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  37.74 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  25.17 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.75 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  31.47 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.76 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.41 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  25.17 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  31.73 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  29.39 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.17 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  28.75 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  32.5 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.57 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.6 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.95 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  40.51 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  27.46 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.04 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  33.06 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  30.59 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  33.59 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  33.47 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  28.41 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  29.79 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.33 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.52 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.37 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  31.33 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  30.61 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  30.61 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  30.61 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  30.61 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.42 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  34.73 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  29.12 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  27.97 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.18 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  25.93 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  33.05 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  33.05 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  26.97 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  30.61 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  26.1 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>