More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6413 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  100 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  96.53 
 
 		 288 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  96.53 
 
 		 288 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  88.54 
 
 		 288 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  87.15 
 
 		 288 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  85.76 
 
 		 288 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  73.96 
 
 		 287 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  73.78 
 
 		 288 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  63.99 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  62.72 
 
 		 286 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  58.95 
 
 		 285 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  62.11 
 
 		 285 aa  318  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.72 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  39.15 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  39.86 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  39.86 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  36.68 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  35.74 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  36.46 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  35.02 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  36.52 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  34.41 
 
 		 295 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  37.28 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  28.72 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  34.59 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  33.33 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  35.04 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  34.07 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  28.95 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  46.46 
 
 		 130 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  36.97 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  34.36 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  34.36 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  34.13 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  37.4 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  32.89 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  26.12 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.09 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  31.03 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  36.17 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.36 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.98 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  33.33 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  29.65 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  32.2 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  29.68 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  34.93 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  32.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  33.91 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  31.17 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  35.09 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.02 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  30.42 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  33.47 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.51 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  32.52 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  29.49 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  27.75 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  24.23 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.85 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  25.78 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  31.71 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  29.49 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  31.69 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  32.3 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  33.04 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.16 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.16 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27.41 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  29.67 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.74 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  29.26 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  34.97 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  30.74 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  30.57 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  34.46 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  28.52 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  31.1 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  29.63 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  33.1 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  33.9 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.44 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.57 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  26.13 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  27.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  28.83 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  28.44 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  29.41 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.39 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.82 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  27.59 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.34 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  27.59 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  33.17 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.88 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1918  NmrA family protein  31.4 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.838838  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.58 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  27.17 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.53 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  29.94 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>