227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5092 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  47.3 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  51.34 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  31.65 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  35.35 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  34.24 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  28.29 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  31 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.23 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.33 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  28.15 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  30.89 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  30.31 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  30.47 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.84 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  29.75 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.33 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.47 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  24 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.95 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.37 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  31.58 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.77 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  28.14 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  26.74 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  30.74 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.68 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  26.78 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.05 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  32.63 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  27.21 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.33 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  26.09 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.39 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.39 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.49 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.65 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  27.21 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.05 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  24.54 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  27.96 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  28.52 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.3 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  27.63 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  28.15 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.2 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.99 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  29.2 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.97 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  27.55 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  29.53 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.24 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  25 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.84 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  22.64 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  25.25 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  27.3 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  26.82 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  26.9 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  25.42 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  28.08 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.51 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  28.12 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  29.66 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  27.46 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  29.19 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  27.24 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.33 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  27.14 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  28.38 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  25.89 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  26.78 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  25.35 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  21.85 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  29.24 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  26.81 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  27.44 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  28.86 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  27.27 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.46 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  25.25 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  25.9 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  26.42 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  25.56 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  26.06 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  28.46 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  26.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  25.27 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  27.94 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  27.94 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  27.24 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  27.94 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  24.04 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  30.77 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  24.73 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.71 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>