161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3848 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  56.66 
 
 		 296 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  53.06 
 
 		 295 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  50.68 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  50.87 
 
 		 291 aa  290  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  48.47 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  48.29 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  48.12 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  45.89 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  45.83 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  47.14 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  44.63 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  45.24 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  41.08 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.95 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  31.82 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  34.94 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  32.3 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.67 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  32.07 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.71 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.88 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  26.83 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  26.92 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  26.79 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  26.02 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  29.63 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.28 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.69 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  29.33 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  29.88 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  28.82 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  31 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29.03 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  28.88 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  26.55 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  28.71 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.54 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.54 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.34 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.42 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  28.64 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  24.21 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  27.42 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  30.2 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  27.93 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.02 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  25.53 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.37 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.75 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  28.19 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.2 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  28.79 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.52 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  27.57 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  26.9 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  25.5 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  25.43 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  28.48 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  26.32 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  27.38 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  25.32 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  25.34 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  26.43 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  26.87 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.32 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.02 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.32 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  29.71 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.2 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  25.66 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  24.23 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.11 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  25.43 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  27.05 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.11 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.61 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  24.41 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  22.62 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  26.78 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  31.5 
 
 		 124 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  27.49 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  24.13 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  25.55 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  22.56 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  21.96 
 
 		 584 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  21.43 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  24.24 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  28.04 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.03 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  26.47 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.97 
 
 		 213 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  27.32 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  24.35 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  23.6 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>