More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0388 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  56.29 
 
 		 305 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  36.48 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  35.86 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  35.59 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  29.71 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.99 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  33.23 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  34.34 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  32.65 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  32.79 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  34.78 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  30.07 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.2 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  36.15 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.35 
 
 		 287 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.17 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.35 
 
 		 287 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  31.21 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  33.76 
 
 		 450 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  29.96 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  37.89 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.54 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  29.37 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  26.86 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  32.39 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  28.53 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  33 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  32.35 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  34.97 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.46 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.46 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.91 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  28.76 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  29.1 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  33.74 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.72 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  30.89 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.95 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  31.98 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6817  hypothetical protein  29.58 
 
 		 145 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.94 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.22 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  29.85 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  31.43 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  23.1 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  27.15 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.9 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.22 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.8 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  33.74 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  30.71 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  28.02 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.65 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  30.08 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.46 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.57 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  29.43 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  25.2 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.05 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  29.33 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.36 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  32.26 
 
 		 512 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.6 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  26.67 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  26.94 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  25.84 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.72 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  31.02 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  26.99 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  38.79 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  28.35 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5254  NmrA-like protein  28.13 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.8 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  28.13 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  26.64 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5633  NmrA family protein  29.18 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  29.56 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  42.24 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  33.64 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.83 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  29.84 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  31.9 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  26.59 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>