107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4977 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  85.76 
 
 		 299 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  59.31 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  59.31 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  57.59 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  57.24 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  56.9 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  58.97 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  56.9 
 
 		 297 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  56.9 
 
 		 297 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  55.71 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  56.46 
 
 		 316 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  46.39 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  45.55 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.32 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  36.82 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  34.47 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  36.05 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  32.06 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  36.49 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  35.84 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  37.2 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  35.49 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  36.86 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  36.86 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.99 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  27.76 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  33.7 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  32.14 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  23.77 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  30.66 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  28.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  24.9 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  31.18 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  26.67 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  29.66 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  28.68 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  28.91 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  23.89 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  29.31 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  30.54 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  23.01 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  29.91 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.08 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.05 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  25.93 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  25.67 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  23.51 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  22.13 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  24.81 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.63 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  24.63 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29.17 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  35.94 
 
 		 130 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  25.84 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  27.04 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  24.62 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  30.51 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.29 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  24.18 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  27.41 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  26.7 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.11 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  23.25 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  38.46 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  27.75 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  26.74 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  26.22 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  25.66 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  26.17 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  27.11 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  25.19 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  24.44 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  36.89 
 
 		 584 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  34.74 
 
 		 232 aa  46.2  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.35 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  25.09 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  37.88 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  24.81 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  37.88 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.23 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.39 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.53 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  36.46 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  24.22 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.72 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  25.42 
 
 		 124 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  39.71 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  26.46 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  39.24 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  35.29 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.21 
 
 		 504 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  28.21 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  22.18 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  38.96 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  33.94 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>