175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2208 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  44.76 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  45.28 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  45.28 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  45.6 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  30.13 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.53 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  31.38 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  33.12 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  36.14 
 
 		 226 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  31.87 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  28.23 
 
 		 688 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.32 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  44.8 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  32.14 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  31.17 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  33.07 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  26.33 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  32.69 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  28.47 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  30.32 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  29.57 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  31.18 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  31.3 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.98 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  30.86 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  29.8 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  30.28 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  29.8 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  31.99 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  30.74 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.92 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  30.52 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.02 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  29.85 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  28.91 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  32.41 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  28.42 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  29.24 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.84 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  40.79 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  29.87 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.64 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  51.25 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.56 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.46 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.37 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.77 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  32.87 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  32.87 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  32.23 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.17 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  32.11 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  33.59 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  28.02 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.15 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  28.44 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  28.42 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  31.06 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.53 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.19 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.24 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.27 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  24.03 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  24.03 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  27.84 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  29.5 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.19 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.19 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49854  predicted protein  27.06 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  29.08 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.37 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.88 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  43.24 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.48 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  29.12 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  29.12 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  23.37 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9088  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.47 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  37.5 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  26.16 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.08 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.74 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.89 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2286  NmrA family protein  31.66 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159289  normal  0.0244583 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  22.12 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  26.67 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.25 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  36.04 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  28.19 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  33.09 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  32.31 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>