284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9088 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9088  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 304 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  51.5 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  31.86 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.51 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2286  NmrA family protein  32.65 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159289  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1172  NmrA family protein  32.48 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.1 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  31.16 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  31.88 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  32.93 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.04 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  31.42 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  31.28 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  33.6 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.92 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  32.02 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.25 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.25 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.75 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  38.16 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  30.89 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  30.89 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.45 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.75 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.18 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.92 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  30.33 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  30.67 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  29.6 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28.8 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.98 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  30.9 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  28.66 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  33.05 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  30.42 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.2 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.33 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  28.57 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  29.88 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  30.48 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.57 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  34.18 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  25.99 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  29.25 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  32.1 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  27.3 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.02 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.23 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.78 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  28.14 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  28.7 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.51 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.19 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.37 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  31.82 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  34.36 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  29.25 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  31.74 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.93 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.18 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  31.27 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.64 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  29 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  30.33 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  29.71 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.3 
 
 		 584 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  27.89 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.7 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.91 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25.53 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  28.35 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.22 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.17 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  27.76 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  34.96 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  31.75 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  28.45 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  34.5 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  27.12 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.39 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.52 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.22 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  33.03 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.08 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.35 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.39 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  23.83 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  28.46 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  28.46 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  27.55 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>