21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1172 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1172  NmrA family protein  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  53.5 
 
 
278 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2286  NmrA family protein  51.92 
 
 
287 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159289  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9088  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.55 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.78 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  28.81 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  27.59 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  25 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  27.11 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  28.21 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  29.49 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  26.99 
 
 
279 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  28.76 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  27.85 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.61 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  27.54 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  27.54 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  26.42 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  25.1 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  25.31 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>