278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3410 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  39.93 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  43.11 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  37.81 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  34.96 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  40.27 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  35.9 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  34.48 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  32.18 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  30.74 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  33.21 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  31.69 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.41 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  33.8 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  32.61 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  27.56 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  27.56 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.95 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  32.64 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  32.75 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  29.89 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.25 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  32.2 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  32.61 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.17 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  29.67 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.48 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.04 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  30.32 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  29.88 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  26.73 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  28.97 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  31.62 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.27 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  34.47 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.15 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.15 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  27.38 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.16 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.47 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  24.91 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  27.64 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  28.4 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  29.2 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.32 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  28.3 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.27 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  30.27 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  26.64 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.73 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  31.05 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  25.65 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.73 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  31.15 
 
 		 584 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  26.73 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  23.25 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.71 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.5 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  30.21 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  25.96 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.42 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  31.17 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  23.05 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  26.55 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  30.77 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  26.67 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.06 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  24.41 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.88 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  26.25 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  31.52 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2314  NmrA family protein  30.34 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.44 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  29.55 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.78 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  30.42 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25.19 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25.19 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  28.74 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  30.2 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  30 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  26.29 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  28.86 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  28.16 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  28.94 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.5 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  29.55 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  30.26 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  28.75 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1172  NmrA family protein  28.21 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.24 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.84 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>