235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0987 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  59.93 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  36.29 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  34.88 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  34.63 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  35.66 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  33.98 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  29.62 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  32.13 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.31 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  33.22 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  32.46 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  32.46 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  29.27 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  29.84 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  30.58 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  31.95 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  28.92 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  29.69 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  29.88 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  29.37 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  29.55 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  29.96 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  29.31 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  26.59 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  27.76 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  29.55 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  28.95 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.17 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.17 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  29.92 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  29.55 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  26.04 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  31.55 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  23.11 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  27.42 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  25.38 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  26.02 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  28.28 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  28.28 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.69 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  24.54 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  28.72 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  28.05 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27.1 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.7 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  23.88 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  27.89 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  26.86 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  23.6 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  22.93 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  26 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  26.44 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.14 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  28.14 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  26.12 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  26.53 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  28.94 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  23.59 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  26.48 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  24.89 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  26.64 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  24.49 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.71 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  26.18 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.64 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.07 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.3 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  25.18 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.59 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.18 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  23.14 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.14 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.04 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.64 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.12 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  30.1 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.24 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  27.12 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  24.34 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  20.69 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  27.71 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  25.41 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  21.71 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  25.2 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  25.6 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  28.42 
 
 		 226 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  31.09 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  23.04 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  23.14 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  21.3 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  26.49 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  24.8 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  23.79 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.59 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.96 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  25.65 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  23.23 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  25 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>