57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1843 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  53.33 
 
 		 286 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  52.5 
 
 		 288 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  48.33 
 
 		 292 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  49.19 
 
 		 300 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 293 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  34.82 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  34.17 
 
 		 312 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  33.93 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  35.11 
 
 		 291 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.82 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  29.6 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  35.71 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  32.14 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  33.93 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  32.03 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  30.77 
 
 		 299 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  31.09 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  33.93 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  32.48 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  26.23 
 
 		 292 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  30.51 
 
 		 290 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  33.93 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  31.5 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  28.91 
 
 		 296 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  29.27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  31.62 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  28.23 
 
 		 308 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  30.3 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  34.82 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  31.2 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  26.23 
 
 		 305 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  26.27 
 
 		 299 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  26.4 
 
 		 297 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  25.42 
 
 		 307 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0239  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000144523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  26.27 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  33.93 
 
 		 288 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  33.93 
 
 		 288 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  25.83 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  29.46 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  26.27 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  26.36 
 
 		 274 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.86 
 
 		 287 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  29.03 
 
 		 288 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  22.32 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  38.81 
 
 		 337 aa  40.8  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  23.85 
 
 		 306 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33.94 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33.94 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>