178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1350 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  48.82 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  48.12 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  49.32 
 
 		 296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  43.88 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  45.58 
 
 		 291 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  38.26 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  41.33 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  39.74 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  38.1 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  37.29 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  38.59 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  38.38 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  35.67 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  27.7 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.78 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  28.57 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  28.32 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.18 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.04 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.48 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  25.89 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.22 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  24.82 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  26.98 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.98 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  27.89 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  25.52 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  25.33 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  25.51 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  25.09 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  23.81 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.38 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  24.23 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  24.67 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  26.32 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  26.7 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  23.35 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  23.35 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.7 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  25.25 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.41 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  27.8 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.1 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  26.54 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  27.03 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  26.18 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  24.83 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  24.83 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  27.69 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.21 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  23.71 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  23.38 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  24.25 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  26.27 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  25.09 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.69 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.69 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.74 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.32 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.46 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  23.38 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  27.31 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  24.89 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  26.22 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.23 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  27.56 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  26.58 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  25.52 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.38 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  24.71 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  25.11 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  25.11 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  25 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.23 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  24.63 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.79 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.16 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  26.59 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.83 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.74 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.71 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.53 
 
 		 196 aa  53.9  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.1 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  24.85 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  26.5 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25.13 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  23.28 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25.13 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.37 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  23.85 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.83 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  25.45 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.11 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.45 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  25.33 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  28.91 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  25.37 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>